Un groupe d'adolescents est embarqué pour une virée en avion par leur ami pilote peu qualifié. Après avoir pris de l'altitude pour éviter un orage, quelque chose tourne mal : le sol a disparu sous eux. Pire, une présence malveillante cachée dans les nuages semble s'en prendre à eux...

A bord d'un avion en provenance de Colombie des ressortissants américains s'apprêtent à rentrer chez eux. Mais, en plein vol, un homme est attaqué par des millions de fourmis cannibales qui finissent par l'achever. Parmi les passagers figurent l'entomologiste Carrie Ross, et l'agent Ethan Hart qui font tout pour stopper cette invasion mortelle et éviter un massacre. Mais le gouvernement américain veut empêcher l'atterrissage de l'avion sur son sol. Les passagers s'en sortiront-ils vivants...