1592. Quatre ans après la défaite de l'Angleterre de l'Armada espagnole, les tensions sont encore profondes, particulièrement entre Sir Francis Drake, "The Queen's Pirate", et son ennemi le Capitaine Don Sandovate. Un rmystérieux sultan syrien,les deux hommes et leurs équipages sont engagés dans une course contre la montre audacieuse, chacun se lance dans une quête désespérée dans des pays exotiques étrangers où ils rencontrent des obstacles périlleux et dangers cachés chacun a leur tour.

La jeune sœur de Manji est tuée devant lui. Malgré son corps détruit, il venge sa petite sœur. Une femme mystérieuse apparaît devant lui. Elle lui donne la jeunesse éternelle et l'immortalité. Les parents de Rin Asano sont tués par le groupe d'épées "Itto ryu" et l'école d'escrime de ses parents est détruite. Pour se venger de la mort de ses parents, elle demande à Manji d'être son garde du corps. Rin et Manji commencent leur combat contre "Itto ryu".