Une fois de plus, Skipper, Kowalski, Rico et Private, dictent leur loi à l'intérieur du zoo de Central Park. Afin de pouvoir garder leur voisinage heureux, les pingouins doivent parfois s'aventurer dans la jungle new-yorkaise afin de ramener de nouvelles trouvailles qui pourront les aider à préserver leur tranquillité. Mais alors que les quatre frères pensent avoir un contrôle absolu sur les autres animaux, un nouvel arrivant fait son apparition : Julien, le roi des lémuriens, doté d'un égo surdimensionné, il passe ses nuits à faire la fête avec ses copains. Exaspéré, les pingouins vont devoir rivaliser de nouveaux stratagèmes pour récupérer leur territoire.

Julien et Marguerite de Ravalet, fils et fille du seigneur de Tourlaville, s’aiment d’un amour tendre depuis leur enfance. Mais en grandissant, leur tendresse se mue en passion dévorante. Leur aventure scandalise la société qui les pourchasse. Incapables de résister à leurs sentiments, ils doivent fuir…