Kom est un jeune Woonkos, tribu de singes de la canopée, dont la hantise est de tomber dans le monde du bas, qu'elle croit peuplé de monstres. Il refuse de croire ces vieilles légendes et se retrouve projeté dans ce fameux monde, l'univers du château des singes.

En 1990, les animaux domestiques et le personnel de service ont disparu au profit des singes-esclaves. Mais ces derniers se révoltent et prennent le pouvoir, sous l'impulsion de Caesar, le fils de Cornélius et Zira...

L'astronaute Brent est envoyé au secours de Taylor, mais s'écrase à son tour sur la "planète des singes". Cherchant à retrouver son compagnon avec l'aide de Nova, il suit sa trace jusque dans la "zone interdite" où il découvre une société de mutants humains télépathes.

Peu après sa naissance, un petit garçon dont les parents viennent de décéder est recueilli par une guenon en pleine jungle d'Afrique équatoriale.