Kidnappée et manipulée depuis l'âge de 5 ans, Phoenix est devenue une des meilleurs tueuses de l'organisation secrète de Madame Rose. Elle n'a jamais échoué à aucune de ses missions. Sélectionnée pour abattre le chef d'Interpol, elle se prépare minutieusement à exécuter son contrat. En étudiant sa cible, elle réalise qu'il pourrait être un membre de sa famille et comprend qu'elle n'a pas été abandonnée mais enlevée de force par l'organisation. Furieuse et survoltée, elle va mettre à feu et à sang tous ceux ont volé sa vie.

ISAAC est le premier prototype de cyborg construit par des scientifiques affiliés à une organisation militaire. Mais ISAAC n'a pas toujours été une arme de guerre robotique. Il n'y a pas si longtemps, il était un être humain lui aussi... Après s'être échappé de l'organisation, ISAAC est maintenant à la recherche de son identité et des véritables intentions de ses créateurs. Dans sa fuite, il prend en otage l'agent Lindsay Rearden, et ensemble, ils découvriront que l'organisation n'est pas vraiment celle qu'elle prétend...

Chine, à l'époque médiévale. Les clans Liang et Wei s'opposent depuis des années, se livrant une guerre sans fin. Au cours d'une bataille, un fantassin parvient à capturer un général de l'armée adverse et compte le livrer à ses supérieurs, pour obtenir gloire et fortune. Les deux ennemis s'engagent alors dans un long voyage jusqu'au quartier général. Un périple qui sera semé d'embûches et de pièges.

Dans un futur proche, le militant islamiste tchétchène Basayev enlève les enfants du Président des États-Unis et prend le contrôle de la centrale de Tchernobyl, menaçant de déclencher un nuage radioactif si ses demandes ne sont pas exaucées. Après des années d'hibernation, l'Universal Soldier Luc Deveraux est réveillé pour intégrer une toute nouvelle équipe secrète d'UniSols afin de déjouer les plans du terroriste. Mais Luc découvre que l'un des Universal Soldiers réanimés est un clone de son vieil ennemi, le dégénéré Andrew Scott. Il doit également faire face au NGU, un soldat nouvelle génération possédant la biotechnologie des Universal Soldiers, devenu incontrôlable...

Rescucité par l'armée américaine et ayant accompli sa dernière mission avec brio, l'universal soldier Luc Deveraux travaille aujourd'hui en tant qu'expert sur un projet du gouvernement visant à améliorer le programme d'entraînement des universal soldiers. Lorsque Seth, le superordinateur qui contrôle les soldiers, devient fou et n'obéit plus aux ordres.