Après avoir perdu sa femme sept ans auparavant, l’excentrique Docteur John Dolittle s’exile derrière les hauts murs de son manoir, avec pour seule compagnie sa ménagerie d’animaux exotiques. Mais quand la jeune Reine Victoria tombe gravement malade, le vétérinaire est forcé malgré lui à embarquer dans une aventure épique vers une île mythique afin de trouver un remède.