Cette nouvelle aventure démarre lorsqu'une cyber-attaque révèle l'identité de tous les agents britanniques sous couverture. Johnny English devient alors le dernier espoir des services secrets. Rappelé de sa retraite, il plonge tête la première dans sa mission : découvrir qui est le génie du piratage qui se cache derrière ces attaques. Avec ses méthodes obsolètes Johnny English doit relever les défis de la technologie moderne pour assurer la réussite de sa mission.

La vie d'une professeur anglais est perturbée lorsqu'un de ses anciens étudiants revient dans sa ville natale.

Tombé en disgrâce, l'agent secret britannique Johnny English s'est réfugié dans un monastère tibétain en rêvant de reprendre du service. Son souhait est sur le point de se réaliser lorsqu'on ses supérieurs font appel à lui pour une dangereuse mission. Le premier ministre chinois est menacé de mort et un seul homme peut faire toute la lumière sur ce complot d'envergure internationale. Au fil de son enquête, l'espion aux méthodes très peu orthodoxes découvre que la compagnie Vortex se trouve derrière cette conspiration. Pour l'arrêter, il devra mettre la main sur trois clés, ce qui obligera une taupe à se dévoiler.

En parfaite new-yorkaise, Nora, la trentaine bien sonnée, s'est développée une carapace à l'épreuve de l'amour. Cynique et désenchantée, elle se demande ce qu'elle pourrait bien faire pour trouver l'homme idéal. Elle n'est pas vraiment aidée par sa mère qui ne perd jamais une occasion de lui rappeler qu'elle est toujours célibataire. Après une série de rendez-vous désastreux, elle rencontre Julien, un français insouciant et joyeux, venu à New York pour travailler sur un film qui finalement ne se fera pas. Nora se laisse un moment convaincre par l'insouciance de Julien, mais redoutant un nouvel échec amoureux, elle se refuse d'y croire et le laisse repartir en France. Prise de remords, elle décide finalement d'aller à Paris, espérant enfin conjurer le sort de son train-train quotidien. Ce voyage sera l'occasion de reprendre en main sa destinée...

Lorsqu'une cyberattaque permet à des mécréants de mettre la main sur l'identité de tous les agents britanniques sous couverture actuellement en fonction, les services secrets de Sa Majesté n'ont d'autres choix que de se tourner vers l'espion Johnny English pour régler cette affaire. Sans hésitation, Johnny sort de sa retraite pour reprendre du service. Il aura pour mission de découvrir qui est le génie derrière cette histoire de piratage qui paralyse son gouvernement. Comme Johnny English n'est pas particulièrement à l'aise avec la technologie moderne, arriver à ses fins sera plus ardu que ce qu'il avait d'abord envisagé.